In speziellen Trennprojekten wird die Membrantechnologie zur Wasseraufbereitung hauptsächlich zur Materialkonzentration, Farbstoffabwasserbehandlung und Proteintrennung in Biopharmazeutika eingesetzt. Nanofiltrationsmembran- und Elektrodialysetechnologien spielen bei der selektiven Trennung in diesen Bereichen eine Rolle, beispielsweise die Nanofiltration zur Trennung von Stoffen mit Molekulargewichtsunterschieden und die Elektrodialyse zur Säure- und Alkalirückgewinnung. Die nachgeschaltete Reinigung in Biopharmazeutika erfordert Ultrafiltration und Mikrofiltration, um Viren oder Zelltrümmer zu entfernen und so die Produktreinheit und -sicherheit zu gewährleisten.